Migrando la web

Ahora todos somos "migrantes" como dice el Gobierno. Intentando cambiar mi web al nuevo servidor de Unizar, siguen los problemas que debato con el centro de ayuda.... Aquí hay algunos de los de hoy:

Veo que después de un tiempo sí han aparecido en mi web, en la nueva ubicación pero con la misma URL que tenían antes, los artículos que subí y que antes estaban en el viejo servidor. Así que por esa parte no parece haber ningún problema. (Son PDFs y se visualizan con normalidad en el navegador dentro de la subcarpeta "publicaciones" en la carpeta "public_html"). Ahora bien, sí persisten algunos problemas y dudas que tengo.

1) Para empezar, de repente el programa de transferencia de ficheros que empleo no abre ya la carpeta "public_html"; me pone un mensaje "Escribiendo el listado public_html" - pero la ruedita nunca para de dar vueltas y no aparece la lista, con lo cual no puedo ni ver nada a través de esta aplicación ni transferir nada a esa carpeta.

2) Hay otra carpeta que funcionaba de manera distinta, transfiriendo por via ftp archivos de word en diversas subcarpetas, dentro de la carpeta "bibliography" (en las subcarpetas "Authors.Schools" y "Subjects"). Se accedía a estos directorios a través de esta portada que sí se ve: http://personal.unizar.es/garciala/bibliography.html

—pero al pinchar en los enlaces, por ejemplo en "Subjects index", aparece este mensaje de error:

Deprecated: Creation of dynamic property DirectoryListing::$soryBy is deprecated in /var/www/html/bibliography/Subjects/index.php on line 558

Y si bien figura el directorio de subcarpetas debajo, éstas ya no se abren y no parecen contener nada, pues aparece este otro mensaje de error:

Not Found

The requested URL was not found on this server.

Apache Server at personal.unizar.es Port 80

—¿A qué puede deberse esto?  Querría revisar las carpetas que figuran en "public_html" por ver si es cosa de mayúsculas y minuúsculas o algo así, pero como he dicho en (1), no puedo acceder ya al directorio mediante la aplicación, pues entra en un bucle infinito.

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En fin, veremos si pasito a pasito. Después de tanto migrar resulta que la nueva dirección habría de coincidir con la antigua, y en efecto algunas cosas se vuelven a ver en las mismas URLs. Veremos si pronto todas.